Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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