Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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