Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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ALCAMQ13740 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
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ALCAMQ13740 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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ALCAMQ13740 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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ALCAMQ13740 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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ALCAMQ13740 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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