Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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