Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRQ13535 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
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