Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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