Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms