Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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