Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACACAQ13085 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACACAQ13085 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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