Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NPRL3Q12980 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPRL3Q12980 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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