Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPEQ02224 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms