Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPFP49454 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPFP49454 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPFP49454 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPFP49454 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPFP49454 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPFP49454 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
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