Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LRRTM2O43300 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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