Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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GDE1Q9NZC3 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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GDE1Q9NZC3 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GDE1Q9NZC3 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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