Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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LHX9Q9NQ69 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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LHX9Q9NQ69 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LHX9Q9NQ69 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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