Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CIPCQ9C0C6 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CIPCQ9C0C6 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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