Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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ZBED3Q96IU2 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED3Q96IU2 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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