Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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