Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LAMA3Q16787 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms