Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYPL1Q16563 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYPL1Q16563 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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