Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SNAPC1Q16533 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SNAPC1Q16533 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SNAPC1Q16533 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SNAPC1Q16533 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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