Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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SNCBQ16143 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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SNCBQ16143 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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SNCBQ16143 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNCBQ16143 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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