Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TAF1AQ15573 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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