Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPAQ15257 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPAQ15257 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms