Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KARSQ15046 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KARSQ15046 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
KARSQ15046 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KARSQ15046 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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