Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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SNX17Q15036 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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SNX17Q15036 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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