Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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SHPRHQ149N8 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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