Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NR1I3Q14994 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1I3Q14994 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms