Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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GBX1Q14549 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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