Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQLEQ14534 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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