Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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CDH18Q13634 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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CDH18Q13634 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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CDH18Q13634 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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