Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TCIRG1Q13488 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms