Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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