Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
AP3B2Q13367 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.9 ms