Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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GPS1Q13098 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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GPS1Q13098 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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GPS1Q13098 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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GPS1Q13098 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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GPS1Q13098 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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GPS1Q13098 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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GPS1Q13098 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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