Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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