Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms