Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PKHD1P08F94 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKHD1P08F94 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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