Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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