Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms