Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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HOXD1Q9GZZ0 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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