Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
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Q6Q795 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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Q6Q795 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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Q6Q795 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
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Q6Q795 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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Q6Q795 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Q6Q795 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
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Q6Q795 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Q6Q795 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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Q6Q795 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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Q6Q795 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Q6Q795 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Q6Q795 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Q6Q795 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Q6Q795 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Q6Q795 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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