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| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC005296.1-201 | ENST00000616145 | 209 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | ST7-OT4_2.1-201 | ENST00000619089 | 172 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | FAM35CP-201 | ENST00000554755 | 2470 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | ZNF479-202 | ENST00000331162 | 2072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | ZNF676-201 | ENST00000397121 | 2944 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
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| CNNM4 | Q6P4Q7 | TBC1D31-206 | ENST00000518805 | 2201 nt | TSL 2 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RGS18-201 | ENST00000367460 | 2150 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | DMD-203 | ENST00000357033 | 13956 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | Y_RNA.276-201 | ENST00000364732 | 109 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | SNORA51.4-201 | ENST00000364993 | 124 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
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| CNNM4 | Q6P4Q7 | MIR3616-201 | ENST00000584070 | 92 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
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| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC010205.1-201 | ENST00000616668 | 449 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | SPAM1-206 | ENST00000460182 | 2154 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | SLC30A6-202 | ENST00000357055 | 4758 nt | TSL 2 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU6-873P-201 | ENST00000363833 | 107 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU6-879P-201 | ENST00000364328 | 108 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | MIR218-1-201 | ENST00000384999 | 110 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | PLCL2-AS1-201 | ENST00000414844 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | DPH3P2-201 | ENST00000422618 | 250 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
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| CNNM4 | Q6P4Q7 | MGAT4C-211 | ENST00000621808 | 2582 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU6-1309P-201 | ENST00000363305 | 108 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | SNORD32B-201 | ENST00000364460 | 84 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | SNORA9.2-201 | ENST00000365361 | 133 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | Y_RNA.458-201 | ENST00000384240 | 102 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU6-1145P-201 | ENST00000384246 | 107 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU6-851P-201 | ENST00000384565 | 107 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | MIR329-1-201 | ENST00000385028 | 80 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | HIST1H2APS3-201 | ENST00000403259 | 134 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU6ATAC10P-201 | ENST00000408635 | 111 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | BMS1P22-201 | ENST00000414726 | 313 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC004869.2-201 | ENST00000436501 | 229 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | SNORA25.14-201 | ENST00000516481 | 132 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC103726.1-201 | ENST00000520785 | 474 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC131281.1-201 | ENST00000522984 | 164 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RPL17P51-201 | ENST00000605218 | 238 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC023490.1-201 | ENST00000614584 | 375 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC008121.3-201 | ENST00000618726 | 433 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC011718.1-201 | ENST00000622906 | 375 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | GABRG2-209 | ENST00000638660 | 3799 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | TAB2-201 | ENST00000367456 | 4553 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | ERBIN-202 | ENST00000380935 | 6692 nt | TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | ATP2B1-201 | ENST00000261173 | 6777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU1-35P-201 | ENST00000362782 | 153 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RNU6-611P-201 | ENST00000384276 | 104 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | Y_RNA.471-201 | ENST00000384312 | 102 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | SNORD78.2-201 | ENST00000391076 | 69 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AL451074.5-201 | ENST00000415894 | 435 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC009969.1-201 | ENST00000438726 | 172 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | RPEP5-201 | ENST00000441137 | 268 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | MTATP8P1-201 | ENST00000467115 | 207 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | MRPS35P2-201 | ENST00000508242 | 191 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNNM4 | Q6P4Q7 | AC023141.11-201 | ENST00000508864 | 202 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |