Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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