Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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