Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms