Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PUM3Q15397 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PUM3Q15397 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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