Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NEDD9Q14511 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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