Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CNGB1Q14028 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGB1Q14028 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms