Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
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